א. כאשר מפעילים את diskpart, אפשר להקליד list volume כדי לקבל את רשימת הכוננים במחשב, עם הגדלים, ולפי"ז לדעת באיזו אות כונן ממוקם הקובץ של הכונן הוירטואלי.
ב. אם הכונן הוירטואלי ממוקם על גבי דיסק חיצוני, בדר"כ לא יהיה ניתן להתקין עליו, וגם אם כן הוא יהיה איטי באופן שקשה מאד לעבוד איתו.
ג. בחלק מהמהדורות של Windows הוא לא מאפשר התקנה לכונן וירטואלי (מהדורת Home למשל).
ד. לפעמים זה נכשל, ללא סיבה נראית לעין...